218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0155 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4075  MOSC domain containing protein  54.63 
 
 
205 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4395  MOSC domain containing protein  56.28 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772534  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  43.75 
 
 
214 aa  162  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0313  MOSC domain containing protein  39.81 
 
 
212 aa  153  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  39.11 
 
 
209 aa  147  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  42.31 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3049  MOSC domain-containing protein  41.56 
 
 
217 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7731  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2753  MOSC domain containing protein  44.52 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1617  MOSC domain containing protein  42.5 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11892  hypothetical protein  43.11 
 
 
251 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.358209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2352  MOSC domain containing protein  40.85 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  41.82 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5316  MOSC domain containing protein  48.72 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00687382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2884  MOSC domain containing protein  41.32 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211052  normal  0.150346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1986  MOSC domain-containing protein  42.41 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.963912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  39.08 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4643  MOSC domain-containing protein  39.63 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9197  hypothetical protein  41.96 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1047  MOSC domain-containing protein  42.07 
 
 
219 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3573  MOSC domain containing protein  43.95 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0326783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  34.48 
 
 
549 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4172  MOSC domain-containing protein  38.41 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4238  MOSC domain-containing protein  38.41 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4394  MOSC domain-containing protein  38.41 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4212  MOSC domain-containing protein  39.02 
 
 
218 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2442  MOSC domain-containing protein  35.98 
 
 
211 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000472936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  31.85 
 
 
221 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17340  hypothetical protein  35.16 
 
 
250 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.210348  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  35.62 
 
 
214 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7062  MOSC domain containing protein  36.36 
 
 
228 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0951  MOSC domain containing protein  38.96 
 
 
210 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0181  MOSC  34.62 
 
 
213 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4375  MOSC domain-containing protein  33.68 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  39.55 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  36.6 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1701  MOSC domain-containing protein  32.56 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  34.62 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1855  mosc domain-containing protein  34.93 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3148  MOSC domain-containing protein  33.12 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0290805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1502  mosc domain-containing protein  31.41 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  36.77 
 
 
229 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  35.26 
 
 
586 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1762  MOSC domain-containing protein  32.07 
 
 
242 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0722092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  32.63 
 
 
234 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1700  MOSC domain-containing protein  32.07 
 
 
242 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000356858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  32.76 
 
 
596 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  35.9 
 
 
588 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3657  MOSC domain containing protein  34.16 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  32.95 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0210  MOSC domain containing protein  34.64 
 
 
242 aa  90.5  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3230  MOSC domain containing protein  31.79 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4178  MOSC domain-containing protein  29.87 
 
 
215 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0596789  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5027  MOSC domain-containing protein  32.69 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  34.62 
 
 
586 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1893  MOSC domain-containing protein  35.26 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0684  hypothetical protein  30.52 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0630  MOSC domain-containing protein  27.89 
 
 
222 aa  89.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.521553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4566  hypothetical protein  29.87 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3877  MOSC  32.7 
 
 
224 aa  89  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  30.92 
 
 
228 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3580  MOSC domain-containing protein  34.3 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.482482  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  32.69 
 
 
581 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  30.92 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  30.92 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  30.92 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0651  hypothetical protein  33.12 
 
 
233 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  31.21 
 
 
235 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  30.92 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4551  hypothetical protein  29.22 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00426926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4524  hypothetical protein  29.87 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  30.92 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  30 
 
 
229 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  31.58 
 
 
234 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3730  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
219 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  34.84 
 
 
234 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4279  MOSC domain-containing protein  29.87 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4513  hypothetical protein  29.22 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.405643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2471  hypothetical protein  29.03 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00092  mosc domain protein  30.98 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4330  hypothetical protein  29.22 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4167  MOSC domain-containing protein  29.22 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4665  hypothetical protein  29.22 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2936  hypothetical protein  29.22 
 
 
229 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0245783  hitchhiker  0.00000764985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  29.84 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0705  MOSC domain-containing protein  28.48 
 
 
222 aa  84.7  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
234 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
234 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3743  MOSC domain-containing protein  26.63 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00289398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2397  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2441  MOSC domain containing protein  34.59 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12104  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  35.33 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  34.84 
 
 
590 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4616  MOSC domain-containing protein  29.56 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111886  hitchhiker  0.00165938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4291  MOSC domain-containing protein  31.71 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  32.1 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  31.21 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  29.14 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>