105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2927 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  319  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  83.64 
 
 		 165 aa  276  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  60.76 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  54.94 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  53.25 
 
 		 206 aa  156  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  55.94 
 
 		 144 aa  154  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  51.72 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  55.24 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  49.69 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  49.31 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  49.04 
 
 		 182 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  52.94 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  44.65 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  49.67 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  42.68 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  41.96 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  41.26 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  41.56 
 
 		 153 aa  97.4  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  37.5 
 
 		 174 aa  90.9  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  41.72 
 
 		 200 aa  90.5  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  44.12 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  39.24 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  38.17 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  42.95 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  40.27 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  38.85 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  37.59 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  33.76 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  36.96 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  36.84 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  42.34 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  36.72 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  35.59 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  36.43 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  34.51 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  40.6 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  40.6 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  40.6 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  30.34 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  37.6 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  36.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  30.5 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  30.28 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  34.85 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  36.11 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  30.61 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  29.58 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1893  MOSC domain-containing protein  37.3 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  32.56 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  34.92 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  30.28 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  30.28 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  32.59 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  32.72 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  31.72 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  33.55 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  29.56 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  30.95 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  29.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  37.19 
 
 		 188 aa  48.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5316  MOSC domain containing protein  34.68 
 
 		 232 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00687382  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0313  MOSC domain containing protein  36.79 
 
 		 212 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  33.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  30.77 
 
 		 201 aa  47.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  31.88 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  34.45 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  35.34 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  39.34 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  29.79 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  32.89 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  32.8 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  32.77 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  33.87 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  30.15 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  33.62 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  34.19 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  32.89 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  32.52 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1580  MOSC domain-containing protein  35.14 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000909232  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  33.06 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  31.45 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  32.28 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  31.43 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  33.59 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  27.78 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  39.73 
 
 		 234 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  26.35 
 
 		 144 aa  42  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>