32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0016 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  75 
 
 		 146 aa  234  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  65.97 
 
 		 148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  65.28 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  64.58 
 
 		 145 aa  197  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  65.28 
 
 		 148 aa  197  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  64.58 
 
 		 145 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  65.28 
 
 		 148 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  63.19 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  61.64 
 
 		 146 aa  187  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  62.94 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  59.87 
 
 		 150 aa  183  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  59.72 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  59.44 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  55.56 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  39.07 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  30 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  30.22 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  31.43 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  29.86 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  30.99 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  29.63 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  27.33 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  29.5 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  27.14 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  29.58 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  28.47 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  25.85 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  28.93 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000026195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  25.87 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>