35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0082 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  326  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  54.2 
 
 
143 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  32.7 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  31.65 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  31.21 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  32.17 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  32.9 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  32.68 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  26.92 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  34.85 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  31.69 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  32.77 
 
 
177 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  30.19 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  26.8 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  29.79 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  28.86 
 
 
178 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  30.3 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  29.49 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  31.93 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  31.62 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  29.68 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  29.29 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  31.78 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  28.97 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  32.59 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  26.44 
 
 
158 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  41.89 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  37.61 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  30.19 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2442  MOSC domain-containing protein  31.52 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000472936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  30.77 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  38.96 
 
 
176 aa  43.9  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  29.23 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  26.38 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>