44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1966 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  303  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  56.13 
 
 
151 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  46.97 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  41.06 
 
 
145 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  41.33 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  40.52 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  40.52 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  41.45 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  41.45 
 
 
148 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  41.45 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  40.13 
 
 
146 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  41.26 
 
 
155 aa  90.5  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  40.79 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  39.87 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  38.97 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  40 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  35.53 
 
 
184 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  36.81 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  34.48 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  35.92 
 
 
175 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  33.79 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  42.34 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  37.25 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  40.54 
 
 
206 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  35.76 
 
 
165 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  37.68 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  38.18 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  26.39 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  31.68 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  36.79 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  31.51 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  31.86 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  39.34 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  30.99 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0055  hypothetical protein  28.71 
 
 
240 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  30.56 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  31.88 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  36 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  28.47 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>