27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0012 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  67.81 
 
 		 147 aa  214  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  66.9 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  66.9 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  66.2 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  66.2 
 
 		 148 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  66.2 
 
 		 148 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  65.49 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  65.71 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  64.79 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  64.79 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  57.86 
 
 		 146 aa  173  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  55.56 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  56.03 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  58.87 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  38.41 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  38.71 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  30.26 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  32.87 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  25.85 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  32.09 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  27.83 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  28 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  29.79 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  28.06 
 
 		 167 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  28.77 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  32.91 
 
 		 184 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>