35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0010 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  67.81 
 
 
149 aa  214  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  68.53 
 
 
145 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  68.53 
 
 
145 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  67.83 
 
 
145 aa  197  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  66.9 
 
 
150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  66.2 
 
 
148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  66.43 
 
 
145 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  66.2 
 
 
148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  66.2 
 
 
148 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  65.49 
 
 
148 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  64.34 
 
 
145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  61.27 
 
 
146 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  58.74 
 
 
146 aa  174  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  59.44 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 
151 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  39.1 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  29.75 
 
 
178 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  31.5 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  31.47 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  26.47 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  28.06 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  32.23 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  29.14 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  25.52 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  25.86 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  30.25 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  30.82 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  27.74 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  32.23 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4797  MOSC domain-containing protein  36.36 
 
 
232 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  28.08 
 
 
182 aa  40.8  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  31.58 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  27.18 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  25.64 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>