76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0530 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  57.66 
 
 
184 aa  172  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  57.93 
 
 
181 aa  165  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  57.04 
 
 
151 aa  164  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  56.34 
 
 
167 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  55.32 
 
 
175 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  57.45 
 
 
182 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  54.55 
 
 
165 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  48.48 
 
 
206 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  48.95 
 
 
177 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  48.25 
 
 
174 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  55.94 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  48.61 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  49.64 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  49.31 
 
 
178 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  47.45 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  49.29 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  47.45 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  35.56 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  33.11 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  36.96 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  35.77 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  30.14 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  32.19 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  28.76 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  31.69 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  34.27 
 
 
178 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  31.62 
 
 
197 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  35.71 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  30.2 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  35.61 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  37.23 
 
 
262 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  33.1 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  31.39 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  31.21 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  34.81 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  29.86 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  36.15 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  39.64 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  36.15 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  36.15 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  36.44 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  31.39 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  34.33 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  35.83 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  33.85 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  34.71 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  29.2 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  31.78 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  33.61 
 
 
201 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  32.61 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  30.65 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  30.65 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  28.69 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  37.04 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  31.06 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  31.03 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  29.84 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  30.3 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  32.09 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  30.15 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  34.23 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  34.51 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  29.66 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  32.23 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  36.61 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  30.94 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  32.37 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0055  hypothetical protein  26.12 
 
 
240 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>