42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0018 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  87.59 
 
 		 145 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  87.59 
 
 		 145 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  86.9 
 
 		 145 aa  261  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  82.52 
 
 		 148 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  82.52 
 
 		 148 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  82.52 
 
 		 148 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  81.82 
 
 		 148 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  78.32 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  67.83 
 
 		 147 aa  197  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  65.49 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  66.9 
 
 		 146 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  65.71 
 
 		 149 aa  191  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  63.38 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  62.94 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  45.27 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  41.33 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  28.47 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  35.53 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  27.46 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  30.5 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  32.14 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  33.57 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  35.34 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  31.78 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  31.06 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  31.03 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  27.59 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  24.5 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  31.78 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  27.07 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  27.82 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  25.35 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  26.32 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  25.74 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  23.24 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  23.24 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  31.73 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  22.95 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  27.19 
 
 		 149 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>