40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1758 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  54.2 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  37.32 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  38.1 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  37.06 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  33.57 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  36.17 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  30.77 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  30.99 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  32.43 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  33.55 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  33.1 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  32.59 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  34.78 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  34.75 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  32.86 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  32.87 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  34.17 
 
 
175 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  33.08 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  33.82 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  35.71 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  33.8 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  34.51 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  30.15 
 
 
181 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  29.71 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  30.99 
 
 
190 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  32.28 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  31.54 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  31.78 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  33.72 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  35.9 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  28.17 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  24.82 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  28.87 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.56 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  26.39 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  27.52 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>