83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2412 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  321  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  40 
 
 
163 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  40.79 
 
 
178 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  38.85 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  35.29 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  40.82 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  37.66 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  39.71 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  39.24 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  40.31 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  36.25 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  42.06 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  36.65 
 
 
181 aa  80.5  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  44.12 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  35.33 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  35.48 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  36.96 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  35.33 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  39.81 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  33.11 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  33.33 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  38.46 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  35.82 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  41 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  33.55 
 
 
178 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  29.68 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  35.53 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  32.87 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  35.25 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  35.61 
 
 
208 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  31.58 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  34.85 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  30.92 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  40.2 
 
 
214 aa  60.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  42.42 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  26.8 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  34.35 
 
 
215 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  34.15 
 
 
197 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  30.32 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  33.09 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  31.82 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  26.95 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1047  MOSC domain-containing protein  33.59 
 
 
219 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  34.29 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  33.85 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  37.59 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9197  hypothetical protein  34.88 
 
 
223 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  37.59 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  37.59 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7062  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
228 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593642  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5316  MOSC domain containing protein  39.58 
 
 
232 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00687382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  28.79 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1986  MOSC domain-containing protein  35.51 
 
 
212 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.963912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2352  MOSC domain containing protein  33.57 
 
 
216 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11892  hypothetical protein  34.26 
 
 
251 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.358209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  29.93 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  30.08 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  31.03 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7731  hypothetical protein  39.18 
 
 
211 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4394  MOSC domain-containing protein  32.14 
 
 
213 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  33.66 
 
 
214 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4172  MOSC domain-containing protein  33.66 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4238  MOSC domain-containing protein  33.66 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1893  MOSC domain-containing protein  31.76 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2884  MOSC domain containing protein  42.42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211052  normal  0.150346 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  26.32 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0313  MOSC domain containing protein  31.37 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  25.5 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  25.5 
 
 
142 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1617  MOSC domain containing protein  34.69 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  29.77 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  28.23 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  27.89 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  29.23 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  32.38 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  37.21 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  32.05 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  26.32 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4212  MOSC domain-containing protein  30.63 
 
 
218 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  37.93 
 
 
241 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  29.63 
 
 
145 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  29.52 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>