46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1526 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  100 
 
 
178 aa  351  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  38.99 
 
 
163 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  40.79 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  39.47 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  41.73 
 
 
153 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  42.67 
 
 
200 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  43.4 
 
 
181 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  37.82 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  92  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  37.91 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  36.97 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  38.1 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  34.46 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  40.31 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  41.18 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  34.27 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  32.28 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  33.81 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  39.02 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  39.17 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  34.81 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  31.03 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  35.11 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  36.44 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  36.89 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  35.59 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  28.86 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  35.43 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  32.69 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  29.69 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  32.32 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  28.37 
 
 
184 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  31.33 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  36.78 
 
 
176 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  30.16 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  25.64 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  25.93 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  31.63 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  29.13 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  32 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  29.71 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  33 
 
 
151 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  36.25 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>