39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1460 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  327  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  59.86 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  40.26 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  39.19 
 
 
190 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  38.26 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  41.22 
 
 
165 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  38.67 
 
 
176 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
158 aa  87.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  35.77 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  38.97 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  38.76 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  38.17 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  35.21 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  36.76 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  35.2 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  39.36 
 
 
206 aa  70.5  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  39.1 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  28.46 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  33.61 
 
 
178 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  34.31 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  31.78 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  29.85 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  31.94 
 
 
189 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  33.82 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  33.08 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  33.58 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  31.06 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  34.43 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  31.82 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  32.84 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  30.97 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  31.47 
 
 
189 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  31.2 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  41.89 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  29.6 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  32.17 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  30.23 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>