36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4326 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  63.53 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  47.77 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  38.87 
 
 		 420 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  37.89 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  36.6 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  31.84 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  36.77 
 
 		 427 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  28.91 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  29.81 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  34.38 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  27.69 
 
 		 401 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  28.91 
 
 		 442 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  28.69 
 
 		 392 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  31.77 
 
 		 412 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  30.4 
 
 		 463 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 400 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  29.74 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  29.05 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  30.67 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  27.27 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  27.12 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  30.52 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  29.63 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  26.98 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  27.47 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  26.92 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5952  hypothetical protein  24.58 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1796  hypothetical protein  28.77 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105142  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2365  hypothetical protein  23.44 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0153021  normal  0.414563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  23.72 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1136  hypothetical protein  33.67 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  26.78 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  23.93 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  26.88 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  23.85 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>