25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0483 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  639    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  46.08 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  28.13 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  27.71 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  30.26 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  29.41 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  26.62 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  24.06 
 
 
413 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  27.23 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  28.87 
 
 
426 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  25.48 
 
 
396 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  25.95 
 
 
380 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  27.15 
 
 
426 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  29.41 
 
 
400 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  25.69 
 
 
443 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  24.21 
 
 
412 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  24.27 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  22.67 
 
 
408 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  24.86 
 
 
471 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  25.14 
 
 
380 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  23.33 
 
 
463 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  23.85 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  25.69 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  26.25 
 
 
366 aa  42.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  25.16 
 
 
387 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>