24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1950 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  28.13 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  29.1 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  25.93 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  26.59 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  27.71 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  26.06 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  26.16 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  26.2 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  25.1 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  28.31 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  27.07 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  25.77 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  23.93 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  26.09 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  26.49 
 
 		 395 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  23.98 
 
 		 463 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  24.5 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  21.52 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  24.16 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  25 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  24.57 
 
 		 412 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  28.03 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  26.4 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>