36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1417 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  784    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  36.78 
 
 
442 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  37.76 
 
 
345 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  32.67 
 
 
400 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  30.45 
 
 
401 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  28.29 
 
 
443 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  28.44 
 
 
471 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  31.28 
 
 
395 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  32.38 
 
 
392 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  31.86 
 
 
413 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  29.25 
 
 
463 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  30.8 
 
 
396 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  27.72 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  37.91 
 
 
426 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  27.41 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  28.24 
 
 
459 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  26.79 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  26.46 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  25.25 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  27.61 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  30.33 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  23.5 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  27.12 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  27.42 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  28.57 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  27.05 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  23.3 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  27.14 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  26.92 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  22.06 
 
 
377 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2365  hypothetical protein  26.13 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0153021  normal  0.414563 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5952  hypothetical protein  24.88 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  26.09 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1796  hypothetical protein  24.42 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105142  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  25.14 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3620  hypothetical protein  22.83 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>