25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3280 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  763    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  76.28 
 
 		 371 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5952  hypothetical protein  38.52 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  36.22 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2365  hypothetical protein  34.95 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0153021  normal  0.414563 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  28.57 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  27.47 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  26.69 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  25.86 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  26.16 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  27.98 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  26.46 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  26.09 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  24.73 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  26.39 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  26.92 
 
 		 413 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  23.91 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  24.1 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  23.42 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  26.56 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  27.44 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  23.87 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  22.64 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  26.13 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  25.84 
 
 		 413 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>