18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2029 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2365  hypothetical protein  52.22 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0153021  normal  0.414563 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5952  hypothetical protein  46.09 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  38.01 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  36.22 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  26.92 
 
 		 313 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  24.13 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  23.23 
 
 		 463 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  34.65 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  22.06 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  37.84 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  21.61 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  28.71 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  22.8 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  32 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  20.45 
 
 		 471 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  23.7 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>