32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1043 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  947    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  54.65 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  30.81 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  25.71 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  33.94 
 
 		 442 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  35.51 
 
 		 345 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  23.83 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  24.1 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  32.14 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  30.18 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  28.24 
 
 		 380 aa  92.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  29.1 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  28.17 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  26.27 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  30.52 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  28.25 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  25.37 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  28.44 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  30.21 
 
 		 396 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  25.71 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  24.4 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  25.81 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  25.76 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2365  hypothetical protein  26.24 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0153021  normal  0.414563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  27.62 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  33.15 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  25.86 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  23.05 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  23.76 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  24.13 
 
 		 377 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5952  hypothetical protein  23.11 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  22.58 
 
 		 335 aa  43.5  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>