19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1796 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1796  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  735    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105142  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  35.56 
 
 
329 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  25.23 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  28.77 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  29.88 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  26.58 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  22.48 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  26.83 
 
 
471 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  26.32 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  23 
 
 
412 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  28.1 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  26.38 
 
 
413 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  24.42 
 
 
380 aa  49.7  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  27.65 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  28.24 
 
 
443 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1600  hypothetical protein  22.19 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  28.93 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  23.03 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  21.45 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>