20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2501 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1796  hypothetical protein  35.56 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105142  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  30.38 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  25.35 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  25.24 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  29.61 
 
 		 413 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  29.25 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  23.98 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  23.72 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  25.86 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  29.25 
 
 		 426 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  32.99 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1136  hypothetical protein  36.11 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  27.32 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  24.09 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  26.51 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  31.82 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  27.74 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  24.4 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>