18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1136 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  39.18 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  35.42 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  30.48 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  32.65 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  33.67 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  36.11 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  24.71 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  25.5 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  27.62 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  25.35 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  25.45 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  25.71 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  27.56 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  33.64 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  24.62 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  28.85 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  26.55 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>