31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1295 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  886    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  36.71 
 
 
396 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  35.68 
 
 
400 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  32.86 
 
 
401 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  29.53 
 
 
395 aa  186  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  30.86 
 
 
392 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  31.3 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  37.91 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  28.46 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  32.8 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  30.49 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  29.74 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  30.1 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  35.14 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  34.67 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  31.21 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  25.48 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  24.5 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  27.41 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  27.54 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  32.28 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  31.97 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  25.63 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  24.4 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  27.18 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  29.93 
 
 
335 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  29.25 
 
 
329 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  27.15 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  25.77 
 
 
312 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  23.82 
 
 
427 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1136  hypothetical protein  25.35 
 
 
334 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>