34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4477 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  826    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  48.17 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  42.39 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  34.54 
 
 		 392 aa  245  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  37.39 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  34.67 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  32.86 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  30.45 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  27.3 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  27.69 
 
 		 313 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  30.6 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  31.64 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  27.43 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  32.91 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  31.65 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  25.76 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  23.29 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  32.95 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  30.86 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  27.15 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  26.91 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  27.02 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  29.1 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  28 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  26.62 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  25.49 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  26.2 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  26.36 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3620  hypothetical protein  20.41 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1796  hypothetical protein  28.1 
 
 		 359 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105142  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1136  hypothetical protein  27.62 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  27.74 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  23.7 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>