More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5257 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  98.72 
 
 
263 aa  320  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5257  integrase catalytic subunit  100 
 
 
156 aa  320  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  98.72 
 
 
263 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  97.44 
 
 
263 aa  315  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 
265 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 
265 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 
265 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 
265 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  67.31 
 
 
265 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1878  ISPsy11, transposase OrfB  66.67 
 
 
272 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  64.33 
 
 
275 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  64.33 
 
 
275 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  64.33 
 
 
275 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  64.33 
 
 
275 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  64.33 
 
 
275 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  63.92 
 
 
287 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  63.92 
 
 
287 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  63.92 
 
 
287 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  61.78 
 
 
266 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  54.19 
 
 
405 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  54.19 
 
 
405 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  54.19 
 
 
405 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  54.19 
 
 
405 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  54.19 
 
 
405 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  54.19 
 
 
405 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0833  integrase, catalytic region  70.37 
 
 
227 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000063104  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3382  integrase, catalytic region  70.37 
 
 
227 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0725  integrase, catalytic region  70.37 
 
 
227 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000044412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1088  integrase, catalytic region  69.44 
 
 
227 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2390  integrase catalytic subunit  58.65 
 
 
240 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.433388  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  58.65 
 
 
240 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  58.65 
 
 
240 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  58.65 
 
 
240 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000318686  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  58.33 
 
 
239 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  47.47 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  47.47 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  47.47 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2059  integrase, catalytic region  71.95 
 
 
201 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.735698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3676  integrase, catalytic region  71.95 
 
 
201 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4796  integrase, catalytic region  71.95 
 
 
201 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3376  integrase, catalytic region  71.95 
 
 
201 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  44.03 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  45.91 
 
 
409 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0907  hypothetical protein  40.13 
 
 
307 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.129322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2296  integrase catalytic region  45.86 
 
 
267 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000687503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
267 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2045  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
269 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  45.86 
 
 
267 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  42.68 
 
 
411 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  45.86 
 
 
267 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  42.68 
 
 
411 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  42.68 
 
 
411 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  42.68 
 
 
411 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  45.86 
 
 
267 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  42.68 
 
 
411 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0092  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
267 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
267 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1381  integrase catalytic subunit  48.63 
 
 
255 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  45.45 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2797  integrase catalytic subunit  44.59 
 
 
267 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.16027  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  47.59 
 
 
255 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
267 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
267 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  46.9 
 
 
255 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0118  hypothetical protein  52.94 
 
 
187 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.834355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  47.59 
 
 
255 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  49.64 
 
 
255 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  49.64 
 
 
255 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  49.64 
 
 
255 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  46.9 
 
 
255 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  49.22 
 
 
234 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  47.73 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  47.73 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2602  integrase catalytic region  46.21 
 
 
266 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000237976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  45.74 
 
 
240 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  45.74 
 
 
240 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  45.74 
 
 
240 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>