More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2161 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  858    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  100 
 
 		 411 aa  858    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  100 
 
 		 411 aa  858    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  100 
 
 		 411 aa  858    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  100 
 
 		 411 aa  858    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  63.79 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  86.8 
 
 		 250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  65.54 
 
 		 267 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  68.6 
 
 		 242 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  68.25 
 
 		 255 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  68.18 
 
 		 242 aa  356  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  68.6 
 
 		 242 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  65.17 
 
 		 267 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  65.17 
 
 		 267 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  65.17 
 
 		 267 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  48.4 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  48.4 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  48.4 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  48.4 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  67.46 
 
 		 255 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  68.25 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  48.4 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  48.4 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  64.42 
 
 		 267 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  64.42 
 
 		 267 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  64.79 
 
 		 267 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  66.02 
 
 		 267 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1381  integrase catalytic subunit  67.86 
 
 		 255 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  67.86 
 
 		 255 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  67.86 
 
 		 255 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0092  integrase catalytic subunit  64.42 
 
 		 267 aa  353  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  65.27 
 
 		 267 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  67.86 
 
 		 255 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  67.46 
 
 		 255 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  68.18 
 
 		 242 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2797  integrase catalytic subunit  64.42 
 
 		 267 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.16027  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  64.04 
 
 		 267 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  64.04 
 
 		 267 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2296  integrase catalytic region  64.04 
 
 		 267 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000687503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2045  integrase catalytic subunit  66.41 
 
 		 269 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  67.77 
 
 		 242 aa  349  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000121412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2602  integrase catalytic region  68.02 
 
 		 266 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000237976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  61.3 
 
 		 268 aa  346  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  69.4 
 
 		 240 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  67.26 
 
 		 234 aa  330  4e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  59.47 
 
 		 278 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  59.47 
 
 		 278 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  59.47 
 
 		 278 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  51.46 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  51.46 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  51.46 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  51.09 
 
 		 275 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  51.09 
 
 		 275 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4293  integrase catalytic subunit  73.6 
 
 		 188 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.942529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  49.62 
 
 		 266 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  48.16 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  48.16 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  48.16 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  47.73 
 
 		 265 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  46.95 
 
 		 263 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  46.95 
 
 		 263 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  46.95 
 
 		 263 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0023  transposase  92.68 
 
 		 132 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0016  transposase  92.68 
 
 		 132 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2424  transposase  92.68 
 
 		 132 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3706  transposase  92.68 
 
 		 132 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1105  transposase  92.68 
 
 		 132 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1494  transposase  92.68 
 
 		 132 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>