More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0572 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  99.59 
 
 		 242 aa  507  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000121412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  100 
 
 		 242 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  89.67 
 
 		 242 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  88.84 
 
 		 242 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  89.26 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  68.18 
 
 		 411 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  68.18 
 
 		 411 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  68.18 
 
 		 411 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  68.18 
 
 		 411 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  68.18 
 
 		 411 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  63.9 
 
 		 409 aa  340  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1381  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  67.23 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  63.9 
 
 		 255 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  63.9 
 
 		 255 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  63.49 
 
 		 255 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  63.49 
 
 		 255 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  63.49 
 
 		 255 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  63.9 
 
 		 255 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  63.9 
 
 		 255 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  64.32 
 
 		 267 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  67.92 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2296  integrase catalytic region  63.9 
 
 		 267 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000687503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  335  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0092  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 		 267 aa  335  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 		 267 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  334  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  334  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  334  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  334  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  67.5 
 
 		 240 aa  334  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2797  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 		 267 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.16027  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 		 267 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2602  integrase catalytic region  63.95 
 
 		 266 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000237976  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2045  integrase catalytic subunit  65.22 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  65.95 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  66.37 
 
 		 234 aa  315  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  58.37 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  58.37 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  58.37 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4293  integrase catalytic subunit  64.48 
 
 		 188 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.942529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  51.48 
 
 		 275 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  51.48 
 
 		 275 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  51.48 
 
 		 275 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  51.05 
 
 		 275 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  51.05 
 
 		 275 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  51.05 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  51.05 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  51.05 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  49.37 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  52.19 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  52.19 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  52.19 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  52.19 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2305  IS3 family transposase  51.09 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2322  IS3 family transposase  51.09 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2538  IS3 family transposase  51.09 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2543  IS3 family transposase  51.09 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.66662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3282  IS3 family transposase  51.09 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3616  IS3 family transposase  51.09 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3056  IS3 family transposase  51.09 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000318686  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1881  Integrase catalytic region  49.15 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.803149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>