More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3398 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  76.32 
 
 		 275 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  75.94 
 
 		 275 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  76.32 
 
 		 275 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  75.94 
 
 		 275 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  76.32 
 
 		 275 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  72.73 
 
 		 287 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  72.73 
 
 		 287 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  72.73 
 
 		 287 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 		 265 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 		 265 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 		 265 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 		 265 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  64.77 
 
 		 263 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  63.94 
 
 		 265 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  64.39 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  64.02 
 
 		 263 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1878  ISPsy11, transposase OrfB  63.22 
 
 		 272 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  60.3 
 
 		 405 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  60.3 
 
 		 405 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  60.3 
 
 		 405 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  60.3 
 
 		 405 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  60.3 
 
 		 405 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  60.3 
 
 		 405 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0833  integrase, catalytic region  68.54 
 
 		 227 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000063104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3382  integrase, catalytic region  68.54 
 
 		 227 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0725  integrase, catalytic region  68.54 
 
 		 227 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000044412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1088  integrase, catalytic region  68.08 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000318686  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2390  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.433388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2059  integrase, catalytic region  71.81 
 
 		 201 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.735698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3376  integrase, catalytic region  71.81 
 
 		 201 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3676  integrase, catalytic region  71.81 
 
 		 201 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4796  integrase, catalytic region  71.81 
 
 		 201 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  49.62 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  49.62 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  49.62 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  49.62 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  49.62 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  50 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  50 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  50 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  47.91 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  48.67 
 
 		 409 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  51.3 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 242 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  49.37 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000121412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  49.59 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  50.86 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  50.86 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  50.86 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  50.86 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  47.51 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  50.86 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  49.59 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  50.86 
 
 		 240 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1381  integrase catalytic subunit  49.59 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  49.59 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  49.59 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  46.74 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  46.74 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  46.74 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  46.74 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  46.74 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  47.13 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>