More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2787 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  99.64 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  99.64 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  99.64 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  75.94 
 
 		 266 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  69.49 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  69.49 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  69.49 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  68.42 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  67.42 
 
 		 263 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  67.05 
 
 		 263 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  66.92 
 
 		 265 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  66.67 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1878  ISPsy11, transposase OrfB  66.67 
 
 		 272 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  63.14 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  63.14 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  63.14 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  63.14 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  63.14 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  63.14 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  66.11 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  66.11 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  66.11 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000318686  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  66.11 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2390  integrase catalytic subunit  66.11 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.433388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0833  integrase, catalytic region  68.22 
 
 		 227 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000063104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3382  integrase, catalytic region  68.22 
 
 		 227 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0725  integrase, catalytic region  68.22 
 
 		 227 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000044412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1088  integrase, catalytic region  67.76 
 
 		 227 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3376  integrase, catalytic region  70.9 
 
 		 201 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4796  integrase, catalytic region  70.9 
 
 		 201 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3676  integrase, catalytic region  70.9 
 
 		 201 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2059  integrase, catalytic region  70.9 
 
 		 201 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.735698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  51.09 
 
 		 411 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  51.09 
 
 		 411 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  51.09 
 
 		 411 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  51.09 
 
 		 411 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  51.09 
 
 		 411 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  48.9 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  48.9 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  48.9 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  47.91 
 
 		 268 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  50 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  52.12 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  52.12 
 
 		 242 aa  248  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  50.36 
 
 		 409 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  52.12 
 
 		 242 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000121412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  51.05 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  52.16 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  52.16 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  52.16 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  52.16 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  52.16 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  52.16 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  52.61 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  52.72 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1381  integrase catalytic subunit  51.19 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  53.14 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  53.14 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  53.14 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  51.88 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  52.72 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  51.88 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>