More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0833 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0833  integrase, catalytic region  100 
 
 
227 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000063104  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3382  integrase, catalytic region  100 
 
 
227 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0725  integrase, catalytic region  100 
 
 
227 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000044412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1088  integrase, catalytic region  99.56 
 
 
227 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3676  integrase, catalytic region  99.5 
 
 
201 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3376  integrase, catalytic region  99.5 
 
 
201 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4796  integrase, catalytic region  99.5 
 
 
201 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2059  integrase, catalytic region  99.5 
 
 
201 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.735698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  72.09 
 
 
263 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  71.63 
 
 
263 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  71.63 
 
 
263 aa  321  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  70.14 
 
 
265 aa  314  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  70.14 
 
 
265 aa  314  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  70.14 
 
 
265 aa  314  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  70.14 
 
 
265 aa  314  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  70.33 
 
 
405 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  70.33 
 
 
405 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  70.33 
 
 
405 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  70.33 
 
 
405 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  70.33 
 
 
405 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  70.33 
 
 
405 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  68.52 
 
 
265 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  68.54 
 
 
266 aa  307  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  68.69 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  68.69 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  68.69 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1878  ISPsy11, transposase OrfB  68.06 
 
 
272 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0252583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  68.22 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  68.22 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  68.9 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  68.9 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  68.9 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000318686  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  68.9 
 
 
239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2390  integrase catalytic subunit  68.9 
 
 
240 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.433388  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  67.79 
 
 
287 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  67.79 
 
 
287 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  67.79 
 
 
287 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 
268 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  52.05 
 
 
411 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  52.05 
 
 
411 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  52.05 
 
 
411 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  52.05 
 
 
411 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  52.05 
 
 
411 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  53.81 
 
 
234 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  52.05 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  53.55 
 
 
240 aa  221  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  51.39 
 
 
242 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000121412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  53.55 
 
 
240 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  53.55 
 
 
240 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  53.55 
 
 
240 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  53.55 
 
 
240 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  53.55 
 
 
240 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  53.33 
 
 
278 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  53.33 
 
 
278 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  53.33 
 
 
278 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  53.62 
 
 
267 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2296  integrase catalytic region  53.62 
 
 
267 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000687503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000215252  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  53.14 
 
 
267 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  53.14 
 
 
267 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000174651  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 
267 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920784  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  53.14 
 
 
267 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 
267 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  52.66 
 
 
255 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 
267 aa  214  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 
267 aa  214  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364149  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 
267 aa  214  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 
267 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  50.7 
 
 
242 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  52.66 
 
 
409 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2077  IS3 family transposase orfB  67.36 
 
 
169 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0205753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  50.7 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>