More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0196 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01480  hypothetical protein  86.89 
 
 		 244 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.909575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  38.35 
 
 		 249 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  37.28 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  42.26 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1884  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2253  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218359  normal  0.132912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 222 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4880  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  33.18 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1727  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3530  transcriptional regulator GntR  35.05 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0471  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.915136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0899  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  34.1 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4418  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.494465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0680  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231512  normal  0.107075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2469  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0914  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4320  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196319  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0867  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0657  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.322488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3471  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3666  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0834  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3930  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709239  normal  0.547681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4006  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>