More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3019 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3019  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0944399  normal  0.171235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2660  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  96.36 
 
 
247 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2803  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  91.43 
 
 
247 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0820852  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2726  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  73.25 
 
 
247 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.104684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0871  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.41 
 
 
250 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.734852  hitchhiker  0.000000123242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6476  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  41.32 
 
 
242 aa  195  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2466  hydrolase, carbon-nitrogen family  37.5 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0704  hypothetical protein  38.1 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.195549  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2231  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36.84 
 
 
249 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.57041  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4898  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.64 
 
 
245 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4461  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.19 
 
 
292 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142746  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1378  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.1 
 
 
247 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0342857  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3639  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.05 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  33.06 
 
 
539 aa  85.5  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2478  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  31.46 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1445  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  27.94 
 
 
540 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  27.94 
 
 
540 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  29.92 
 
 
538 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  27.53 
 
 
540 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  31.85 
 
 
539 aa  78.6  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.58 
 
 
566 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1802  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  26.42 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0264  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.85 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  28.22 
 
 
573 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.67 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.58 
 
 
566 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  32 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0104  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  32.38 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  30.92 
 
 
564 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  32.38 
 
 
554 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0741  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.14 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  28.22 
 
 
538 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  28.95 
 
 
556 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1492  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.52 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.578498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1295  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.24 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0367632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  28.19 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  31.58 
 
 
556 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  30.58 
 
 
541 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  32.4 
 
 
538 aa  72.4  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.06 
 
 
566 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2588  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.61 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.581907  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  27.8 
 
 
562 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0765  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.97 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  24.58 
 
 
575 aa  69.7  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5522  carbon-nitrogen hydrolase  37.8 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1050  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.8 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.42 
 
 
587 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  29 
 
 
545 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0708  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  29.24 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.02 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  29.21 
 
 
548 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  28.88 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.02 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  29.85 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2191  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.79 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.856583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3063  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  29.83 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1345  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.922844  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2821  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.18 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.15 
 
 
535 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  27.17 
 
 
576 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  28.52 
 
 
565 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  30.65 
 
 
571 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  27.27 
 
 
559 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0991  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  32.67 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  26.62 
 
 
557 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2086  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08660  predicted amidohydrolase  28.4 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.68483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  28.69 
 
 
545 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001533  glutamine amidotransferase chain of NAD synthetase  27.43 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.999014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1543  hypothetical protein  31.39 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  28.57 
 
 
545 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1348  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.67 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0424099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  28.86 
 
 
554 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  30.08 
 
 
586 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  27.52 
 
 
566 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  28.7 
 
 
567 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4513  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142068  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2669  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.91 
 
 
579 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  25.3 
 
 
542 aa  62.4  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.3 
 
 
542 aa  62  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  24.49 
 
 
574 aa  62  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  28.57 
 
 
545 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  28.16 
 
 
577 aa  62  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  31.73 
 
 
558 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  28.7 
 
 
567 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  29.46 
 
 
590 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17730  hypothetical protein  30.04 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3846  carbon-nitrogen hydrolase family protein  28.83 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1699  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.95 
 
 
543 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  26.92 
 
 
571 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  30.74 
 
 
601 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  30.77 
 
 
558 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  30.47 
 
 
598 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0051  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.03 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.64 
 
 
577 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  26.04 
 
 
567 aa  59.3  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  26.95 
 
 
570 aa  59.3  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1311  putative carbon-nitrogen hydrolase  30.12 
 
 
296 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.852346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>