More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2803 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2803  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0820852  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3019  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  91.43 
 
 
247 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0944399  normal  0.171235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2660  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  91.02 
 
 
247 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2726  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  73.55 
 
 
247 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.104684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0871  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.22 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.734852  hitchhiker  0.000000123242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6476  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  41.74 
 
 
242 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2466  hydrolase, carbon-nitrogen family  36.91 
 
 
249 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0704  hypothetical protein  38.53 
 
 
249 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.195549  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2231  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36.84 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.57041  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4898  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4461  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142746  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1378  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  35.43 
 
 
247 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0342857  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3639  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  32.92 
 
 
539 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2478  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  31.46 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  28.22 
 
 
538 aa  82  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  30.36 
 
 
564 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  30.99 
 
 
541 aa  82  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.71 
 
 
566 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  30.36 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1445  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.05 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  29.13 
 
 
538 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.53 
 
 
540 aa  79  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  27.2 
 
 
540 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  27.2 
 
 
540 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.17 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  26.78 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  33.74 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  32.52 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0104  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  30.91 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  30.65 
 
 
554 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  30.65 
 
 
554 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.75 
 
 
566 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0741  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1492  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.52 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.578498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.46 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1295  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.24 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0367632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  29.15 
 
 
548 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  27.8 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0708  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  30.51 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  29.53 
 
 
561 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  26.98 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  28.46 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  30.59 
 
 
552 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  29.37 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2588  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.7 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.581907  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1802  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  26.05 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.23 
 
 
573 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.04 
 
 
587 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  27 
 
 
557 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0264  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  27.57 
 
 
545 aa  69.7  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.89 
 
 
535 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.63 
 
 
577 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0765  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0991  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  35.47 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.31 
 
 
574 aa  68.6  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2191  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.856583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1345  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.61 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.922844  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3063  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  29.41 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.34 
 
 
556 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  29.55 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1050  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  25.48 
 
 
542 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  28.63 
 
 
545 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  27.52 
 
 
566 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.02 
 
 
576 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  29.7 
 
 
586 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  26.69 
 
 
559 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.48 
 
 
542 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.02 
 
 
576 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5522  carbon-nitrogen hydrolase  36.51 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  29.96 
 
 
544 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  29.03 
 
 
571 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  28.24 
 
 
545 aa  65.5  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  31.03 
 
 
558 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1699  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.19 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  30.13 
 
 
539 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  28.63 
 
 
545 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.27 
 
 
543 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2669  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.72 
 
 
579 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  26.54 
 
 
570 aa  65.1  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3846  carbon-nitrogen hydrolase family protein  29.28 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  28.7 
 
 
567 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  29.53 
 
 
553 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.7 
 
 
577 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  26.94 
 
 
545 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  28.7 
 
 
567 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  25.56 
 
 
561 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  23.98 
 
 
583 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  25.56 
 
 
561 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  29.69 
 
 
598 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2086  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  28.57 
 
 
577 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  26.98 
 
 
553 aa  62.4  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  27.45 
 
 
571 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  27.13 
 
 
546 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  27.31 
 
 
576 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0782  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  31.58 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1543  hypothetical protein  31.39 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>