More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1623 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 86 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  98.84 
 
 		 86 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  95.35 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  91.86 
 
 		 86 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  81.4 
 
 		 93 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  78.05 
 
 		 86 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  94.2 
 
 		 79 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  79.27 
 
 		 83 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  83.54 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  76.83 
 
 		 86 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  72.15 
 
 		 79 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  78.87 
 
 		 83 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  75 
 
 		 77 aa  133  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  70.51 
 
 		 82 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  70.51 
 
 		 82 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  83.08 
 
 		 90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  70.13 
 
 		 77 aa  127  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  65.38 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  55 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  62.16 
 
 		 75 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  60.81 
 
 		 74 aa  97.4  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0577  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 72 aa  87.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9266  predicted protein  55 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  52.31 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  48 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  44.3 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  44.3 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  37.93 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  50 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  44.29 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  47.69 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  43.59 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  50 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  40.62 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  50 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  50 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  41.33 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  45.21 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  51.52 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  40 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>