More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1321 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  100 
 
 
98 aa  204  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  86.96 
 
 
79 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  85.71 
 
 
77 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  86.57 
 
 
77 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  68.29 
 
 
86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  81.82 
 
 
90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  79.1 
 
 
83 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  73.53 
 
 
94 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  73.91 
 
 
93 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  65.38 
 
 
86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  65.38 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  72.46 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  71.01 
 
 
86 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  69.57 
 
 
79 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  69.57 
 
 
86 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  71.64 
 
 
83 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  71.21 
 
 
82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  71.21 
 
 
82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  58.82 
 
 
105 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  60.94 
 
 
74 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
75 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0577  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
72 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9266  predicted protein  47.06 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0629418 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  53.85 
 
 
69 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  50.75 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  50 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  42.65 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  46.15 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  46.15 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  51.56 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  49.21 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
72 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  45.59 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  37.76 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  44.12 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  42.42 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  44.62 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  49.21 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 
74 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  42.19 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  45 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  44.12 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  44.78 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  39.71 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  44.44 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  49.28 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 
70 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  49.21 
 
 
68 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  46.15 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
73 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  40.91 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  41.54 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  36.36 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  46.27 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  49.15 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  46.97 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  44.12 
 
 
100 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  44.78 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  36.92 
 
 
70 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>