More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0348 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 83 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  82.93 
 
 		 93 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  88.61 
 
 		 79 aa  150  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  79.27 
 
 		 86 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  79.27 
 
 		 86 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  79.27 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  94.12 
 
 		 94 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  79.52 
 
 		 86 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  82.5 
 
 		 86 aa  143  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  78.31 
 
 		 86 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  77.92 
 
 		 83 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  69.51 
 
 		 82 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  71.6 
 
 		 77 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  69.51 
 
 		 82 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  70.67 
 
 		 77 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  83.33 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  67.95 
 
 		 79 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  68.57 
 
 		 98 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  53.09 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  61.84 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  64.06 
 
 		 74 aa  94.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0577  50S ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 72 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  52.94 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9266  predicted protein  55 
 
 		 71 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  47.69 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  43.21 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  46.77 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 71 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  41.98 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  41.98 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  45.83 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  46.15 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  47.56 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  42.25 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  52.17 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  49.28 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  35.56 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  45.21 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  46.97 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  40 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  45.21 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  44.59 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  50 
 
 		 72 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>