More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1810 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  100 
 
 		 74 aa  155  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  73.44 
 
 		 175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  71.88 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  71.88 
 
 		 66 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  71.88 
 
 		 65 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  68.75 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  64.29 
 
 		 70 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  58.67 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 66 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  60.27 
 
 		 73 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 65 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  60 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  63.77 
 
 		 73 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  62.86 
 
 		 70 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  63.77 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  63.77 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  63.77 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 94 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  62.86 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  64.06 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 66 aa  98.6  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  68.18 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 66 aa  97.4  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  62.32 
 
 		 71 aa  97.4  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  61.76 
 
 		 74 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  59.46 
 
 		 75 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 71 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  57.81 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  60.87 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  61.76 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  63.24 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  57.33 
 
 		 74 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 75 aa  94.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 75 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 71 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 68 aa  94.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  60.29 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  56.16 
 
 		 75 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 68 aa  94.4  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 71 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 72 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  60 
 
 		 71 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  68.33 
 
 		 73 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 75 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 68 aa  94  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 73 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 72 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  59.46 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  56.06 
 
 		 73 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  61.76 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 71 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  57.33 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  54.05 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 71 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  50.67 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 74 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  53.95 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  56.52 
 
 		 71 aa  90.9  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>