More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0577 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0577  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 72 aa  151  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  69.44 
 
 		 74 aa  117  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  71.01 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  58.57 
 
 		 94 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 86 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 86 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  57.75 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  56.34 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  58.73 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  38.89 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  45.76 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  42.19 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  46.97 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  46.58 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  42.47 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  44.29 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  48.48 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  40.28 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  36.36 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  34.85 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  34.85 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>