More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2003 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  100 
 
 		 100 aa  211  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  93 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  66 
 
 		 99 aa  146  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  54 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  63.24 
 
 		 94 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  56.16 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  50.68 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 72 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  49.32 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  52.24 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  50.68 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  45.83 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  50.68 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  43.06 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  75.5  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  53.85 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  56.92 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  51.52 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  53.85 
 
 		 70 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  49.32 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  45.95 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  46.03 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  50 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 70 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  38.89 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  51.35 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  47.14 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  52.31 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  52.31 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>