More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18000 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  100 
 
 		 68 aa  140  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  63.08 
 
 		 66 aa  95.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  61.19 
 
 		 71 aa  94.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  59.7 
 
 		 70 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  60.61 
 
 		 73 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  55.88 
 
 		 71 aa  90.5  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 72 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 68 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  63.49 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 67 aa  84.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 74 aa  84.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  50 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 70 aa  83.6  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 67 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 75 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  54.55 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  55.93 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 66 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  53.03 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 65 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  51.52 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  50 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  50 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 66 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>