More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1101 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 86 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  98.84 
 
 		 86 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  82.76 
 
 		 94 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  81.71 
 
 		 86 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  81.01 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  78.05 
 
 		 86 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  78.05 
 
 		 86 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  92.86 
 
 		 79 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  76.74 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  79.52 
 
 		 83 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  72.94 
 
 		 83 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  73.08 
 
 		 79 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  75.68 
 
 		 77 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  67.07 
 
 		 82 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  67.07 
 
 		 82 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  86.15 
 
 		 90 aa  129  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  71.05 
 
 		 77 aa  127  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  71.01 
 
 		 98 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  51.19 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  56.76 
 
 		 74 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0577  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 72 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9266  predicted protein  56.67 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  49.23 
 
 		 66 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  45.33 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  39.74 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  38.71 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  43.94 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  43.24 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  46.97 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  35 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  39.47 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  39.47 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  49.15 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  43.84 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  43.66 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  41.43 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  48.48 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  41.67 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  40.62 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0140  50S ribosomal protein L31  37.21 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  48.48 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  39.39 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  48.48 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>