More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0140 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0140  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 92 aa  192  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  70.65 
 
 		 92 aa  147  4e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  46.05 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  44.74 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  42.31 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  42.31 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  43.42 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  42.11 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  37.93 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  43.94 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  43.94 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  39.39 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  39.51 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  38.82 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  37.21 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  41.77 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  39.68 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  37.21 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  40.91 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  39.71 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  39.68 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  37.93 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  40.3 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  35.06 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  39.39 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  41.43 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  42.65 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  34.07 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf449  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  39.51 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  41.27 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  40.85 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  41.27 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  38.24 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  38.24 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  34.38 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  39.44 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  38.82 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  40 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  39.39 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  36.51 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  41.1 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  41.67 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  39.71 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  40.3 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  37.84 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  38.81 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  34.15 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>