More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18350 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  100 
 
 		 71 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  73.53 
 
 		 80 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  73.53 
 
 		 70 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  75 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  70.42 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  78.46 
 
 		 75 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  75 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  69.01 
 
 		 71 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  72.06 
 
 		 71 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  67.61 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  66.2 
 
 		 74 aa  106  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  71.01 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  67.16 
 
 		 74 aa  105  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0323  ribosomal protein L31  67.65 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.100308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  67.65 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  67.65 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  69.57 
 
 		 70 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  68.57 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  69.12 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  65.22 
 
 		 70 aa  103  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  65.67 
 
 		 74 aa  103  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  66.18 
 
 		 74 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  66.2 
 
 		 81 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  66.2 
 
 		 81 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  68.12 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  66.2 
 
 		 81 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1303  50S ribosomal protein L31  70.97 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  62.86 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  66.18 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  63.24 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  67.65 
 
 		 70 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  63.24 
 
 		 69 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 74 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  60.61 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1285  ribosomal protein L31  73.53 
 
 		 72 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 74 aa  90.9  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  55.71 
 
 		 73 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 71 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 71 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  55.88 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 73 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5136  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 68 aa  87  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 68 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 71 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  54.29 
 
 		 73 aa  87.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  51.52 
 
 		 66 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  54.29 
 
 		 72 aa  86.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  62.9 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  50.7 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 71 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 72 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  52.11 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  52.11 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  55.88 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 72 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  53.85 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  51.52 
 
 		 73 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  53.62 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>