More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4835 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 65 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  67.69 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 71 aa  96.7  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  64.62 
 
 		 70 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  60 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  56.92 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  63.08 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 73 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 68 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 65 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  60 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 66 aa  84.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 74 aa  84.3  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  58.33 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 69 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 65 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 72 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  57.58 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  54.55 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  50 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 66 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 71 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  54.55 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  50 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  53.03 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>