More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3074 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  100 
 
 
99 aa  209  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  66 
 
 
100 aa  146  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  66 
 
 
100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  54 
 
 
105 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  67.19 
 
 
94 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  51.95 
 
 
75 aa  93.6  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  53.62 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  54.41 
 
 
70 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
70 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
68 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
69 aa  86.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  48 
 
 
75 aa  87  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  57.14 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  49.33 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  48 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  53.03 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  55.56 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  50 
 
 
76 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  47.83 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  50 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  48.53 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  53.97 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  53.97 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  45.83 
 
 
73 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  50.72 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  48.48 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  52.94 
 
 
67 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  53.73 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  51.52 
 
 
67 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  49.3 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  49.3 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  49.3 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  49.3 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  50.79 
 
 
74 aa  76.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
66 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  49.3 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  47.83 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  51.47 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  50.77 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  47.06 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  53.85 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  39.02 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  36.26 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  47.76 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 
66 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  48.53 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  40.26 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  50.77 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  43.84 
 
 
72 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 
70 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  41.27 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  52.31 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  45.83 
 
 
70 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  53.12 
 
 
67 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 
66 aa  72  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  43.48 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  50 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  45.45 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  47.06 
 
 
73 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  47.76 
 
 
73 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  47.76 
 
 
72 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  43.94 
 
 
66 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  41.67 
 
 
77 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  40.74 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  42.67 
 
 
74 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  39.74 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>