More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1861 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 72 aa  150  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  85.92 
 
 		 75 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  84.93 
 
 		 75 aa  131  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  85.51 
 
 		 75 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  82.61 
 
 		 75 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  81.16 
 
 		 75 aa  123  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  83.33 
 
 		 70 aa  120  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  67.69 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  58.33 
 
 		 73 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  61.43 
 
 		 73 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  68.66 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  70.31 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 72 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 65 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  63.08 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  60 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  58.46 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 74 aa  90.1  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  59.15 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  60 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  56.16 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  63.64 
 
 		 70 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  87.8  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  59.72 
 
 		 74 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  56.16 
 
 		 76 aa  87  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  60.56 
 
 		 72 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  58.11 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  54.05 
 
 		 86 aa  86.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 69 aa  87  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  57.53 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 72 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  55.88 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 100 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  55.41 
 
 		 73 aa  84.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 79 aa  84.3  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  63.24 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 79 aa  84.3  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0323  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.100308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  58.82 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 72 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  54.79 
 
 		 75 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  54.79 
 
 		 75 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  55.41 
 
 		 73 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 72 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 70 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 74 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 68 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 68 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  50.7 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 71 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 70 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  53.42 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  56.06 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  52.94 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>