More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0062 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  100 
 
 		 68 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  69.7 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  59.09 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 69 aa  90.1  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  58.21 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 65 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 74 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 73 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 68 aa  86.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 73 aa  86.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  54.55 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 71 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  84.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  51.52 
 
 		 73 aa  84.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 65 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  50.75 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 71 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  57.58 
 
 		 70 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 65 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  83.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 72 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  52.94 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 72 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  52.94 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  80.1  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>