More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0411 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  100 
 
 		 70 aa  148  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  55.88 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  56.06 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  47.14 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 73 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  52.94 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  46.97 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 175 aa  72  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  48.48 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  46.15 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 72 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  41.79 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  47.46 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  53.23 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  44.12 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  48.48 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>