More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1087 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  100 
 
 		 70 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  82.86 
 
 		 70 aa  126  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  73.53 
 
 		 74 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  73.53 
 
 		 69 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  72.06 
 
 		 71 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  72.86 
 
 		 75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  73.53 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  72.86 
 
 		 70 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  72.46 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  70 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  73.53 
 
 		 76 aa  107  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  72.46 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  71.01 
 
 		 71 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 74 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  70 
 
 		 75 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  71.01 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  71.01 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  69.12 
 
 		 80 aa  103  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  68.57 
 
 		 70 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  67.14 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0323  ribosomal protein L31  67.65 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.100308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  63.24 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  67.65 
 
 		 68 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  67.14 
 
 		 71 aa  101  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  72.31 
 
 		 75 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 72 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 74 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 71 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 71 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  60.29 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  66.18 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  64.29 
 
 		 75 aa  95.9  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  63.77 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  63.64 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 71 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  66.18 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  63.08 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  62.86 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1285  ribosomal protein L31  73.91 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 74 aa  94.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  65.67 
 
 		 72 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 74 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 72 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  60.29 
 
 		 73 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  60.61 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 72 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  60 
 
 		 71 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  59.15 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 66 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  64.29 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  60.29 
 
 		 71 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 72 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 73 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 65 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1303  50S ribosomal protein L31  62.9 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 		 74 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  60.61 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 68 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 68 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  58.57 
 
 		 75 aa  87  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5136  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  54.55 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>